Les rayons ultraviolets d’un système UV tuent les bactéries, virus, levures, champignons, algues et autres micro-organismes, sans utiliser de produits chimiques. Ce traitement est fréquemment utilisé dans les hôpitaux, notamment pour que l’eau contenue dans les réservoirs tampons des autoclaves reste stérile.
Après le filtre UV, les conduites doivent bien entendu être stériles. Sinon, l’eau est à nouveau contaminée par les différentes impuretés se trouvant au sein même des conduites. Dans la pratique, on travaille donc généralement avec des conduites plutôt courtes et bien entretenues. Si la qualité des conduites n’est pas garantie, il est possible d’ajouter un dosage de hypochlorite de sodium (NaOCl) afin de désinfecter l’eau.